(一) 2020年，对重大项目申报进行无纸化试点。申请人登录内蒙古自治区自然科学基金网络信息系统(网址: http://106. 74.147.25)于2020年1月10日前在线填写《内蒙古自治区自然科学基金项目申请书》(2020版，以下简称申请书)， 提交到依托单位科技管理部门；各依托单位科技管理部门于2020年1月15日前在线审核通过后，盟市单位提交盟市科技局和财政局审核、区直单位提交自治区主管部门]审核;盟市和自治区的有关部门审核通过后，于2020年1月20日前在线提交自治区科技厅、财政厅。
(二)其他类型项目采取线上和线下申报相结合的方式。博士基金、面上项目、杰出青年培育基金项目采取纸质材料与网上申报相结合的方式申报。申请人登录内蒙古自治区自然科学基金网络信息系统(网址: http://106.74. 147.25)下载填写《内蒙古自治区自然科学基金项目申请书》(2020版， 以下简称申请书)，同时打印2份纸质文档，将纸质材料和电子版申报材料报送本单位科技管理部门。各依托单位科技管理部门将申报材料统打包， 盟市单位报送盟市科技部门和财政部门，由盟市科技局和财政局联合推荐上报科技厅和财政厅；区直单位报送自治区主管部门，由主管部门推荐上报科技厅和财政厅。电子版网络系统上传截止日期为2020年1月10日，各依托单位科技管理部门须从自治区自然科学基金申报系统中打印申请项目汇总清单，连同2份纸质文档加盖单位公章报送盟市科技局和财政局、自治区主管部门。各依托单位科技管理部门报送盟市科技局和财政局、自治区主管部门截止日期为2020年1月15日，盟市科技局和财政局、自治区主管部门于2020年1月20日前报至科技厅和财政厅。